BiMM - Bioaktive Metaboliten aus Mikroorganismen

BiMM - Bioaktive Metaboliten aus Mikroorganismen

„Bioaktive Metaboliten aus Mikroorganismen-BiMM“ ist eine im Jahr 2014 ins Leben gerufene Forschungskooperation, die am Standort Campus Tulln durch die Universität für Bodenkultur und die Veterinärmedizinische Universität Wien errichtet wurde. Diese, als für alle Forschungsgruppen zugängliche „research-core-facility“ betriebene Einheit, beinhaltet einen Gerätepark in dem durch spezialisiertes wissenschaftliches Personal automatisiertes Hochdurchsatz-Screenen zum Auffinden und Charakterisieren von bioaktiven Substanzen aus Bakterien, Pilzen, Algen und Suspensionskulturen anderer Organismen möglich ist. Die Einrichtung erlaubt es, neue bioaktive Stoffe zu finden und ihre Wirkungsweise zu charakterisieren, die z.B. als Antibiotika, medizinische Wirkstoffe, Biokatalysatoren oder als Pflanzenschutzmittel und in der Umweltbiotechnologie eingesetzt werden können. Neue, transdisziplinäre Forschungsprojekte können damit vollständig am Campus Tulln abgewickelt werden und erhöhen damit auch die Attraktivität des Standortes für weitere nationale und internationale Kooperationen sowie für die Zusammenarbeit mit Firmen. Kontakt: Univ.Prof. Joseph Strauss Weiterführende Informationen: www.bimm-research.at

Metabolomics von Pflanzen

Metabolomics von Pflanzen

Metabolomics ist eine junge, aufstrebende Forschungsdisziplin, die darauf abzielt, durch vergleichende Untersuchungen herauszufinden wie die Gesamtheit der Stoffwechselprodukte eines Organismus durch gezielte (a)biotische Störungen beeinflusst wird.

Wir verwenden hauptsächlich LC-MS und GC-MS basierte Methoden für die Entwicklung innovativer Metabolomics-Abläufe. Ein Schwerpunk unserer Arbeiten liegt dabei auf dem systematischen Einsatz von In-vivo Stabilisotopen-Techniken (13C, 15N, 34S) für die verbesserte Metabolom-Annotierung, genauere metabolomweite Quantifizierung, Substanzstruktur-Charakterisierung und die Entwicklung neuer Software für die automatisierte Datenauswertung.

Unsere Forschung basiert auf enger interdisziplinärer Zusammenarbeit mit Partnern aus der Bioinformatik, Molekularbiologie oder den Pilz- und Pflanzenwissenschaften.

Die entwickelten Methoden werden derzeit angewendet um das Metabolom und die Interaktion filamentöser Pilze, Bakterien und Pflanzen zu untersuchen.

Forschungsschwerpunkte

  • Entwicklung und Anwendung von Metabolomics-Methoden
  • Studium von Mikroben, Pflanzen & deren Interaktion
  • Analytik sek. (LC-HRMS), prim. (GC-MS) & flüchtiger (HS-GC-MS) Substanzen
  • Aufreinigung, Isolierung & Charakterisierung bioaktiver Substanzen
  • Qualitätssicherung im Bereich Metabolomics

Ausstattung

  • Voll ausgestattete Labors zur Probenaufarbereitung
  • HPLC-HRMS(/MS) - Orbitrap MS
  • 3 x QTrap MS/MS mit UPLC
  • automatisierte HS-SPME-GC(EI/CI)-MS
  • GC-MS zur Online-Derivatisierung
  • HPLC-DAD mit Fraktionskollektor
  • Präparative HPLC-DAD/ELSD
  • Datenbanken und (selbstentwickelte) Software zur Datenauswertung

Kontakt: Univ.Prof. Rainer Schuhmacher Weiterführende Informationen: Metabolomics